Почему же ? Если программа будет коректно завершать работу системы и выключать компьютер, почему же диски должны "сдыхать"?
Даже если он будет выключатся раз или два в сутки на 2 часа , считается вредно ?
Физика описана выше...
Это нормально. Но при таком раскладе я бы его вообще не выключал.