А еще несколько дросселей без внимания оставили? О Ваших

А еще несколько дросселей без внимания оставили?
О Ваших вариантах включения:

1. наверное входные транзисторы закрыты, дежурки нет и т.д.
2. это еще веселее, напоминает КЗ как по входному Vin, так и по одному из выходных питаний.
А раз это носит не постоянный характер - осмотр платы, вдруг где-то, что-то касается и замыкает, пробивает. Потому как зарядник уходит в защиту только при КЗ по входному питанию (или возможно, по КЗ после входных транзисторов - хотя при таком варианте скорее эти транзисторы будут закрыты).
И сразу - блок питания рабочий?
3. В эти счастливые моменты неплохо бы обмен на флешке и LPC посмотреть.
Кнопка, как правило, идет на EC.
Ваша разрисовка - это только маленькая часть того, что есть. Вроде сказал, что во многих платах входными транзисторами может управлять ШИМ зарядки. И не слова об этом, проверили - не проверили.
Если хотите всю цепь пройти, то берите доступные схемы на сони, среди них ищите с аналогичным чарджером. И по ней проверяете.
Пока все размыто и не ясно, потому и ответы больше - гадание.