При включении выставляет родную частоту

Приведите замеры напряжений на матплате.
Обязательно указав напряжение батарейки.

После этих действий будем гадать ставить диагноз, а так мои гадальные карты показывают весьма неопределённо что у вас там случилось.

Какие БП и конденсаторы на плате?

Ядро цп 1.85 V скачет от 1.82 до 1.87
+3.3 V от 3.31 до 3.34 V
+5 V от 5.13 до 5.19 V
+12 V от 11.86 до 12.16 V
-12 V от -11.87 до -12.20 V

-5 V от -5.20 до -5.30 V
+5 V резерв 4.97 V
Батарея VBAT 3.31 V

Это без нагрузки. А если дать большую нагрузку на процессор, Vcore проседает и скачет от 1.74 до 1.88; +12 до 11.80; остальные почти стабильно.
Процессор celeron с номинальным питанием 1.75 v
БП LC-B250ATX В нем кондеры стоят на выходе +12 - 1000 мкф, на +3.3 - 470 мкф. Вчера заменил их, так как вздутые и емкость упала в два раза.
На матплате на выходе Vcore 9x1500 мкф на вид целые, но добавил еще емкостей 11000 мкф.
Еще усилил линию доп питания +12 которая к полевикам ядра. Все это почти не повлияло на стабильность питания и вообще.

Может дело не в питании, а какая-то фича.
Пытался менять частоты разными прогами из под винды (setfsb), но они не могут менять, разве что на 2% уменьшить удавалось. Например можно пытаться задать до 124 (это предел стабильности) но ничего не меняется. А если пытаться еще выше то комп сразу виснет, до выключения питания. Как будто задаваемая частота успевает примениться на секунду.
PLL RTM660-107R
Еще в HWDIRECT, в CMOS нашел байт, который меняется при задании частоты в биосе. По адресу 5С значение частоты в hex. Изменил его, частота не сменилась, а после перезагрузки получил настройки биоса как после сброса cmos.

А вы похоже большой юморист, раз проц на ядре Willamette (наверное самый горячий и потребляющий на таких частотах) пытаетесь разогнать на дешёвой материнке с нонейм блоком питания.
Есть на некоторых материнках такая фича как сброс разгона при нестабильности.

Там бы осцилом проверить, мож какая фаза хандрит. А может там сокет BGA и какой то VID так отваливается? Вы бы нормальное название материнки привели.

Ага, я смотрел старым осциллографом, Vcore на кондерах скачет почти также, процентов на 20 меньше. И 12в тоже.
А что за фаза? Чипы стабилизаторов не смотрел еще, просто VID3 там паял, но это недавно.

Раньше я только частоту в биосе менял, ничего не вольтмодил и однако оно перестало сбрасывать. Может со временем опять перестанет.

А может память виновата, этот чипсет только до DDR-200 поддерживает, а стоит DDR-400.
работает на пониженной частоте 120 вместо 200.

Мать Jetway P4MDPT
Память DIMM1: Nanya M2U51264DS8HC2G-5T 512 Mb PC3200 DDR SDRAM (3.0-3-3-8 @ 200 MHz) (2.5-3-3-7 @ 166 MHz)

Вот это да.... Куда же вы их там столько там же теперь не пойми что творится....
Если вы с сумарной ёмкостью промахнётесь, то там такое начнётся, что мало никому не покажется.

А как там выглядит осцилограмма выходных напруг с БП, потому что БП совсем не фонтан судя по тому что было написано выше, я в такие ставлю нормальные БП(от 300W и производители которые себя зарекомендовали хорошо), а тут всего 250W и то непонятно каких

Проц этот весьма плохо гонится. 1.7 обычно стабильно работают на 1.8-1.85 максимум. Если плата тянет нортвуд - замените проц и будет вам счастье.

Похоже да, отпаял 2 кондера по 4700, были на задней стороне платы, минусами на другие кондеры припаивал ))
Оставил один 2200 там даже место под него специально было. И вроде так стабильнее стало.
Похоже они сглаживают только короткие по времени скачки, которые с периодом около 1 милисек, а сами еще короче, хотя там хаоса много. Бывают скачки на порядки длиннее. Амплитуда у коротких и длинных доходит до тех значений, как выше писал, тут кондеры бессильны.

На БП, на линии 12 теже хаотические скачки амплитудой гдето 0.4 в, только они сглажены, нету коротких.

to Artell
Значит больше похоже на проблемы с БП, нежели с самой материнкой.

Кстати ваша замена кондеров большего количества на меньшее, но с другой ёмкостью ни к чему хорошему не приведёт, в частности при условии что вы хотите гнать проц, при этом уменьшаете фильтрующие качества электролитов(хотя с тем колдунством что у вас, я вообще не понял куда характеристики сместятся), лучше подберите более подходящие ёмкости.

И добавьте керамики в параллель батареи кондеров возле сокета, дабы улучшить жизнь конденсаторам.