Конечно же можно. В любом случае команда

Конечно же можно. В любом случае команда format.com a: /s отформатирует дискету и перебросит на неё системные файлы - 4 шт. - один из которых можно/нужно удалить. Оставить следует только :
command.com
io.sys
msdos.sys
Ну а потом уже копировать/создавать autoexec.bat со строкой запуска прошивальщика, сам прошивальщик и прошивку.
_______________
Да, тут не принято несколько своих сообщений писать сразу одно за другим