Unreal Конечно не факт, потому

Unreal Конечно не факт, потому и спрашиваю, но в целом номиналы деталей совпадают, даже полевик стоит тот же что и в даташите, в даташите на него подаётся 3,3В на выхлопе должно быть 2,5В.....

Если вы про тот что отдельно стоит (параметрический), то вы правы скорее всего на него 3,3 идет.
Попробуйте выпаять транзистор Q3 2N7002(по даташиту) - он не дает ШИМу запускаться в случае если что то не с остальными питаниями..... но на свой страх и риск. Скорее всего у вас нет 3,3 вольта потому и срабатывает защита.

Насчет резинки не шутил, просто она хорошо удаляет окислы с контактов.
Распиновка ПСИ-Е pinouts.ru/Slots/pci_express.shtml Померьте напряжения на ПСИ-Е шине. А дальше прозвонкой до полевика. Возможно нет 3,3 вольта на самом разъеме материнки (допустим контакт подмялся).