В штатной и нештатной ситуации ЭДС самоиндукции дросселя - задача нижнего плеча (транзистора/диода). Тут уже стоит вопрос о скорости реакции диода и скорости закрытия верхнего плеча.
Все верно. Только речь-то не об основном дросселе, индивидуальном для каждой фазы, а о входном дросселе фильтра, который стоит по входу +12V, между коннектором и блоком конденсаторов. И если "убрать" этот блок кондеров, входной дроссель получается включенным как раз последовательно со стоками верхних транзисторов, и демпфировать выбросы с него после закрытия одного из транзисторов просто некому...