В смысле почему разное напряжение

В смысле "почему разное напряжение"?
Потому что матплата поддерживает процессоры под socket AM3. Эти процессоры кроме напряжения питания VCCP (вычислительные ядра процессора) имеют еще и напряжение питания VCC_NB (часть СМ, перенесенная в процессор). Т.е. из 5 выходных дросселей четыре относятся к 4-хфазному преобразователю VCCP, а один дроссель - к однофазному преобразователю VCC_NB. Оба преобразователя управляются L6717.

Разные напряжения на выходах разных преобразлвателей - это нормально. А вот нормальность конкретных значений напряжений - это уже под вопросом. Я могу погадать на то, что сейчас отрабатывается только стартовое напряжение, а дальнейшей настройки напряжения не происходит по каким-то причинам.

Можете поставить используемый процессор на заведомо исправную матплату и измерить нормальные рабочие значения VCCP и VCC_NB для вашего экземпляра (при условии, что заведомо исправная матплата не завышает/занижает напряжения программным путем).

В остальном было бы неплохо проверить выходные напряжения всех стабилизаторов на матплате, просмотреть матплату на предмет сколотых деталей и порванных дорожек, измерить напряжение на контакте A15 PCI слота.